Elektronická fakturácia (e-faktúra) bude na Slovensku povinná od 1. januára 2027, ako vyplýva z predbežnej informácie k návrhu zákona o DPH. Zavádza sa aj povinnosť v reálnom čase oznamovať údaje z faktúr Finančnej správe. Cieľom je zefektívnenie výberu daní, zníženie administratívnej záťaže a boj proti daňovým únikom. Týkať sa bude len platiteľov DPH, nie všetkých podnikateľov. Fakturácia sa bude vzťahovať najprv na tuzemské transakcie a od roku 2030 aj na cezhraničné. Faktúry budú musieť byť vystavené a prijaté v štruktúrovanom formáte, ktorý umožní automatizované spracovanie.
Každá vystavená faktúra sa bude musieť registrovať cez štátny systém, čo má zabezpečiť jednotnosť a dostupnosť faktúr Finančnej správe aj odberateľom. Digitalizácia umožní okamžitý prístup k údajom, efektívnejší dohľad nad daňovými povinnosťami a rýchlejšie odhalenie podozrivých transakcií. Ministerstvo financií očakáva zjednodušenie obchodovania, zníženie chybovosti, vyššiu kvalitu výmeny údajov a dôveryhodnosť medzi partnermi. Od roku 2026 dôjde aj k zmenám v oblasti registrácie a zrušenia registrácie na DPH.
Finančná správa v roku 2025 spustila projekt na digitalizáciu fakturačných procesov. Cieľom je vytvorenie štandardizovaného elektronického prostredia s úsporou nákladov a skracovaním procesov. Systém bude fungovať na sieti Peppol, ktorú využíva približne 20 krajín EÚ. Podnikatelia sa budú môcť stať certifikovanými poskytovateľmi prístupu do siete. Decentralizácia má znížiť riziko výpadkov a vytvoriť konkurenčné prostredie pre kvalitné a dostupné služby.
Niektoré deklarované výhody však podnikatelia spochybňujú – napríklad zníženie nákladov na tlač faktúr je už dnes často irelevantné, keďže mnohí používajú elektronické faktúry. Združenie podnikateľov Slovenska upozorňuje na viaceré riziká: technické problémy, počiatočné náklady, bezpečnostné hrozby, obmedzenie flexibility, potrebu vyšších IT zručností a komplikácie pri opravách drobných chýb.
Návrh čelí kritike aj pre technickú náročnosť systému, keďže nie je zatiaľ jasne definované, ako bude komunikácia s Finančnou správou prebiehať. Obavy panujú aj z výpadkov systému a ich dopadov na fakturáciu. Nejasnosti existujú v tom, aké údaje bude potrebné nahlasovať, pričom sa vyžaduje súlad medzi rôznymi účtovnými systémami. Odborníci odporúčajú zamerať sa len na kľúčové údaje. Niektoré návrhy žiadajú zaviesť aj ďalšie prvky, ako povinný IBAN na faktúre či archivačnú funkciu systému. Objavili sa aj požiadavky na automatický import faktúr do účtovníctva.
Viaceré profesijné organizácie požadujú, aby e-faktúra nahradila iné oznamovacie povinnosti, ako je kontrolný výkaz DPH. Ak budú faktúry automaticky evidované, mohol by byť tento výkaz zrušený, čo by znížilo administratívu. Verejnosť žiada, aby bol systém bezplatný pre všetkých podnikateľov, najmä malých a stredných. Medzi obavami je aj ochrana citlivých údajov, keďže elektronická fakturácia bude vyžadovať ich zdieľanie s Finančnou správou.
