Platiteľ DPH, ktorý predáva tovar alebo službu v zníženej sadzbe, je povinný uplatniť daň v stanovenej výške a nemôže svojvoľne používať inú sadzbu. Identifikácia správnej sadzby býva pre obchodníkov náročná, pretože sadzby sa líšia aj pri príbuzných produktoch. Téma znižovania DPH je často predmetom politického marketingu a rozhodovanie o zaradení produktov do nižších sadzieb býva niekedy unáhlené a neodborné. Napríklad v roku 2020 sa na určité zdravé potraviny stanovila 10 % sadzba DPH, pričom niektoré druhy zeleniny, ako paradajky či kapusta, do tejto skupiny patrili, no mrkva či zeler buľvový nie. Podobne sú služby, ako reštauračné podávanie jedál na mieste, zdaňované 10 % sadzbou, zatiaľ čo donáška alebo predaj jedál so sebou spadá pod základnú sadzbu. Alkohol v reštauráciách má vždy základnú sadzbu 20 %.
Od roku 2023 sa zaviedla 5 % sadzba na výstavbu a obnovu štátom podporovaných nájomných bytov a od roku 2025 sa rozšíri na ďalšie produkty. Konsolidačný balíček zároveň zvýši základnú sadzbu DPH na 23 %, čo zdraží tovary ako elektronika, pohonné látky či služby ako MHD, taxislužby či vstupy na kúpaliská. Zároveň sa zruší 10 % sadzba a väčšina tovarov z tejto kategórie prejde na 5 % sadzbu, napríklad knihy, lieky a vybrané potraviny. Niektoré produkty však budú mať paradoxné sadzby – napríklad ovčiu bryndzu 5 %, no ostatné syry nie. Z pečiva sa do 5 % kategórie zaradí len čerstvý chlieb a určité typy pečiva s presnou hmotnosťou.
Chaotické rozdelenie do sadzieb spôsobuje aplikačné problémy. Napríklad potraviny pestované na Slovensku, ako cvikla, majú vyššiu DPH ako dovážané olivy. Hygienické potreby určené na inkontinenciu budú mať 5 % DPH, no menštruačné potreby zostanú v základnej sadzbe. Vzhľadom na zložitosť systému sa podnikateľom odporúča konzultácia s daňovým poradcom. Obchodníci upozorňujú, že namiesto znižovania daní na niektoré produkty by bolo prospešné upratať systém a zjednotiť sadzby podľa logických kategórií. Súčasné rozdelenie do troch sadzieb sa považuje za neprehľadné a komplikované. Apeluje sa na zaradenie všetkých potravín do jednotnej, najnižšej sadzby, čo by posilnilo potravinovú bezpečnosť a zjednodušilo systém. Zavedenie 10 % sadzby ako univerzálnej pre všetky potraviny a služby by bolo považované za dostatočné a zrozumiteľné pre všetkých.